二手红外光谱仪使用后的清洁是保养中不容忽视的一个环节，尤其是模具在压缩之后，如果需要的话忽略在维持期间中，以水洗涤，洗涤后不能被存储在一个干燥的容器，以避免所使用的要求和酸。如果测量样品不够干燥，则应在干燥后用红外灯干燥几分钟，然后干燥并测试。 二手红外光谱仪在使用过程中需要注意以下几个事项：
要符合规定的环境条件来使用，值得相信的红外光谱仪厂家提醒要注意实验室的温度以及相对湿度都应该在标准范围以内，所用电源应配备有稳压装置和接地线。为了更好的把关这些条件，红外实验室的面积不要太大，能放得下必须的仪器设备即可，但室内一定要有除湿装置。还有实验室里的CO2含量不能太高，因此实验室里的人数应尽量少，无关人员最好不要进入，还要注意适当通风换气。
在使用红外光谱仪时，如供试品为盐酸盐，因考虑到在压片过程中可能出现的离子交换现象。强调标准规定用代替溴化钾进行压片，但也可比较压片和溴化钾压片后测得的光谱，如二者没有区别，则可使用溴化钾进行压片。
为防止仪器受潮而影响使用寿命，红外实验室应经常保持干燥，即使仪器不用，也应每周开机至少两次，每次半天，同时开除湿机除湿。特别是霉雨季节，最好是能每天开除湿机。还有使用红外光谱仪测定用样品应干燥，否则应在研细后置红外灯下烘几分钟使干燥。试样研好并具在模具中装好后，应与真空泵相连后抽真空至少2分钟，以使试样中的水分进一步被抽走，然后再加压到一定的标准后维持几分钟。
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